二房追认十一世的吴东玄祖为本房太公，今已传至廿七世或廿八世。二房人丁分布在衙前围、沙埔、石鼓垄和将军澳，衙前围二房人丁单薄，战后在衙前围居住的只有3家人。将军澳吴氏是一条大分支，约于清乾隆中业开基，跟衙前围吴氏没有来往。祖坟位置不详，族人只拜祭总太公吴成达祖。二房没有尝产和祖堂，跟长房、三房和四房共管吴氏宗祠和至德公立学校，在吴成达祖有一位司理代表。