二房追認十一世的吳東玄祖為本房太公，今已傳至廿七世或廿八世。二房人丁分布在衙前圍、沙埔、石鼓壟和將軍澳，衙前圍二房人丁單薄，戰後在衙前圍居住的只有3家人。將軍澳吳氏是一條大分支，約於清乾隆中業開基，跟衙前圍吳氏沒有來往。祖墳位置不詳，族人只拜祭總太公吳成達祖。二房沒有嘗產和祖堂，跟長房、三房和四房共管吳氏宗祠和至德公立學校，在吳成達祖有一位司理代表。